अलग-अलग तरह की ऑटोइम्यून बीमारियां होने के बावजूद ऐसी कई बीमारियों के लक्षण एकसमान होते हैं जिनमें थकान, जॉइंट पेन, त्वचा संबंधी समस्याएं, पेट दर्द, ग्लैंड्स में सूजन और अन्य शामिल हैं। जब शरीर का नैचुरल डिफेंस सिस्टम अपनी व फॉरेन सेल्स में अंतर नहीं कर पाता और नॉर्मल सेल्स पर हमला करने लगता है तब ऑटोइम्यून बीमारियां होती हैं।